QPix Microbial Colony Picker

Antibiotische Hemmzonen

Die Wirksamkeit eines Antibiotika-produzierenden Bakterienstammes auf einen Ziel-Bakterienstamm kann über die Größe des Hemmhofs gemessen werden, den er auf dem Bakterienrasen erzeugt. Die QPix Software ermöglicht es Ihnen, mikrobielle Kolonien, die Hemmhöfe bilden, schnell zu identifizieren, einzustufen und zu picken. Eine intelligente Bildanalyse macht die Vermessung und Einstufung der Hemmhöfe innerhalb eines Rasens auf Basis der Koloniegröße, des Durchmessers des Hemmhofs und der Kompaktheit möglich.

Biokraftstoffe

Biodiesel, ein energiereicher transportabler Kraftstoff, der hauptsächlich aus Triazylglyzeriden zusammengesetzt ist, ist eine der prominentesten Quellen für alternative Energie. Die Biodieselproduktion mit Lipid-produzierenden mikrobiellen Systemen umfasst das Screening tausender Klone mit einer Vielzahl von Tests, wie z. B. Bizinchoninsäure (BCA)-Assays, Messungen der optischen Dichte und Gaschromatographie-Assays. Die QPix Colony Picker automatisieren die Aufgabe des Kolonie-Pickens, ein arbeitsintensiver und fehleranfälliger Prozess, wodurch Arbeitsabläufe zum Auffinden von geeigneten Kandidaten effektiv verkürzt werden.

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Blau/Weiß-Screening

Das Screening von bakteriellen Transformanten, die rekombinante Plasmide mit klonierten Geninsertionen besitzen, ist ein wesentlicher Schritt des molekularen Klonierens. Eine kolorimetrische Reportermethode, die „Blau/Weiß-Screening“ genannt wird, ermöglicht eine bequeme Identifizierung von rekombinanten und nicht-rekombinanten Kolonien aufgrund ihrer Farbe. QPix Colony Picker bieten eine automatisierte Lösung, die speziell für ein genaues kolorimetrisches Blau/Weiß-Screening entwickelt wurde, bei der Weißlicht-Imaging für eine effektive Überprüfung der Transformationseffizienz eingesetzt wird. Auch andere kolorimetrische Ansätze, wie das „Rot/Weiß-Screening“ können mit diesem System durchgeführt werden. 

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DNA-Sequenzierung

Sequenzierung ist das Ablesen der genauen Abfolge von Adenin (A)-, Guanin (G)-, Cytosin (C)- und Thymin (T)-Nucleotiden innerhalb eines DNA-Moleküls. Shotgun-Sequencing ist eine Methode, bei der die DNA in Fragmente von je einer Kilobase zerlegt wird, diese Fragmente in ringförmige Plasmide subkloniert und in Bakterien transformiert werden. Das automatisierte Kolonie-Picken ist für einen höheren Durchsatz und die Plasmidisolierung zum Zweck der Sequenzierung entscheidend. Die QPix Colony Picker sind für ihre Zuverlässigkeit und Genauigkeit bekannt und wurden während des Humangenom-Projekts in vielen Sequenzierungszentren angewendet. Viele Bereiche der Forschung, wie z. B. die Impfstoffentwicklung, nutzen weiterhin traditionelle Sequenzierungstechniken.

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Monoklonale Antikörper (mAbs)

Monoklonale Antikörper (mAb) stammen von einer einzigen Elternzelle ab und binden daher ausschließlich an ein einziges Epitop. Der Begriff „Monoklonale-Antikörper-Discovery“ bezieht sich in der Regel auf das Screening und die Identifizierung von spezifischen Antikörpern, die zum Zweck der Diagnose und Behandlung von Krankheiten gegen ein spezifisches Epitop gerichtet sind, wie gegen ein Coronavirus-Epitop bei der COVID-19-Erkrankung.

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Phage Display

Das Phage-Display ist eine Technik, die die Untersuchung der Protein-, Peptid- oder DNA-Interaktion mit einem Zielprotein ermöglicht. Dieses molekulare Werkzeug macht die Entdeckung von hochaffin bindenden Molekülen möglich, indem Bakteriophagen dazu verwendet werden, ein Zielprotein auf der Außenseite der viralen Hülle zu präsentieren, während die DNA, die das Zielprotein codiert, innerhalb der viralen Hülle verbleibt. Die entstandenen präsentierenden Phagen können im Hoch-Durchsatz-Format bezüglich ihrer Bindung gegen eine Bibliothek von Peptiden oder Proteinen gescreent werden. QPix Colony Picker können verwendet werden, um das Animpfen, Ausplattieren, Verteilen und Picken im Arbeitsablauf eines Phage-Display zu automatisieren.  

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Proteinevolution

Proteinevolution beschreibt die Veränderungen in der Form, Funktion und Zusammensetzung von Proteinen im Verlauf der Zeit. Die gerichtete Evolution von Proteinen hat sich als eine wirksame Strategie zur Veränderung oder Verbesserung der Aktivität von Makromolekülen für industrielle, Forschungs- und therapeutische Anwendungen erwiesen. Mit mehreren Fluoreszenzfiltern ist das System mit einer großen Bandbreite an fluoreszenten Klonierungsvektoren kompatibel. Das ermöglich es den QPix Colony Pickern, einzigartige Informationen über einzelne Kolonien aufzufinden, wenn die Faltung von Proteinen, Enzymevolution und Lokalisierung von Proteinen untersucht wird. Dies umfasst auch die Suche nach Transformationsmarkern und das Screening auf Mutationen.

Synthetische Biologie

Synthetische Biologie ist ein breit gefasster Begriff, der sich auf die Manipulation genetischer Signalwege zu dem Zweck bezieht, die Leistung bestehender biologischer Systeme auf neuartige Arten und Weisen zu nutzen (oftmals zur Produktion von Molekülen und Proteinen). Die synthetische Biologie wendet Prinzipien auf biologische Systeme an, die ursprünglich aus dem Ingenieurwesen stammen, insbesondere die „Planen-Bauen-Testen-Lernen-Zyklen“. Indem sie sich Arbeitsabläufe mit hohem Durchsatz zunutze machen, können Wissenschaftler aus dem Feld der synthetischen Biologie diesen Prozess beschleunigen.

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