Das Oxford Drug Discovery Institute nutzt das FLIPR System, um therapeutische Mechanismen für neurodegenerative Erkrankungen zu erforschen

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UNTERNEHMEN/UNIVERSITÄT

Alzheimer’s Research UK finanzierte das Oxford Drug Discovery Institute an der University of Oxford

TEAM-MITGLIEDER

Dr. Franziska Guenther,

Dr. Katherine England,

Dr. James Taylor,

Dr. Emma Mead,

Prof. Paul Brennan,

Prof. John Davis,

Dr. Emma J. Murphy

VERWENDETE PRODUKTE

FLIPR Tetra Zelluläres High-Throughput-Screening-System

ScreenWorks Software

Die Herausforderung

Das Forschungsteam von Dr. Emma J. Murphy widmet sich der Erforschung therapeutischer Ansätze für neurodegenerative Erkrankungen. Zu diesem Zweck untersuchen sie die Auswirkungen von Inhibitoren der Ubiquitin-spezifischen Protease 30 (USP30), die sich als potenzieller therapeutischer Ansatz zur Förderung der Mitophagie (der Beseitigung geschädigter Mitochondrien) bei neurodegenerativen Erkrankungen erwiesen haben.

Um diese Berechnungen mittels kinetischer Charakterisierung mit hohem Durchsatz durchzuführen, hat das Team einen biochemischen Test mit dem FLIPR® Tetra-Instrument entwickelt. Vor der Verwendung des FLIPR® Tetra verwendete das Team einen Mikroplatten-Reader eines Drittanbieters, um die Spaltung eines Substrats mit der Bezeichnung Ub-Rho durch USP30 zu überwachen. Diese Methode, die auf der Messung des Anstiegs der Fluoreszenz basiert, eignete sich hervorragend für die Bestimmung von IC50-Werten (die Konzentration eines Inhibitors, die die Enzymaktivität um 50%) reduziert) im Hochdurchsatzverfahren. Allerdings war der Zugang zu frühen Zeitpunkten und die Durchführung kinetischer Messungen nur begrenzt möglich. Dies lag daran, dass das Substrat in die Platte gegeben werden musste, bevor sie in das Instrument eingesetzt wurde, und die Wells der Platte einzeln gemessen wurden.

Dr. Emma J. Murphy
„Mit dem FLIPR® Tetra, das mit einem 384-Pipettiererkopf ausgestattet ist, können wir das Enzym oder Substrat direkt zugeben, um die Reaktion auszulösen. Das wirklich Spannende ist, dass wir alle 384 Wells gleichzeitig messen können, sowohl vor als auch unmittelbar nach dem Auslösen der Reaktion. Diese einzigartige Fähigkeit ermöglicht es uns, frühe Zeitpunkte zu erfassen und kinetische Daten mit einem hohen Durchsatz zu generieren, was mit herkömmlichen Platten-Readern nicht möglich war.“
– Dr. Emma J. Murphy.

Die Lösung

Ursprünglich für die Überwachung des Calcium-Flux in Zellen erworben, hat sich das FLIPR Tetra als außergewöhnliches Werkzeug für die Untersuchung der Enzymkinetik erwiesen. Zusätzlich zu den Calcium-Flux-Assays führt das Team nun verschiedene biochemische Assays mit dem FLIPR Tetra durch, wie z. B. den Phosphat-Produktions-Assay und den bereits erwähnten fluorogenen Deubiquitinase-Assay.

Das FLIPR Tetra hat dem Team als unschätzbare Plattform gedient, die es ihm ermöglicht, biochemische kinetische Assays mit hohem Durchsatz durchzuführen. Dank dieses Ansatzes konnten sie aussagekräftige und zuverlässige Daten generieren und gleichzeitig komplizierte kinetische Parameter schnell bestimmen. Der durch diese Methode erzielte höhere Durchsatz ermöglicht es dem Team, kinetische Daten viel früher im Ablauf der Wirkstoffforschung in wichtige Entscheidungsprozesse einzubeziehen.

„Mit dem FLIPR® Tetra sind wir in der Lage, präzise kinetische Konstanten für 16 Verbindungen in weniger als 10 Minuten zu bestimmen. Diese bemerkenswerte Geschwindigkeit ermöglicht es uns, an einem einzigen Tag 48 Platten zu bearbeiten und mehr als 750 Verbindungen zu bewerten. Im Vergleich dazu würden wir mit herkömmlichen Methoden Wochen brauchen, um das gleiche Arbeitsvolumen zu bewältigen.“
– Dr. Emma J. Murphy.

Verwendete Produkte

FLIPR Penta Hochdurchsatz-Zell-Screening-System und die ScreenWorks Software

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Die Ergebnisse

Increase of fluorescence overtime as the fluorogenic Ub-Rho substrate

A) Das Team hat Screenshots aufgenommen, die zeigen, wie die Fluoreszenz im Laufe der Zeit zunimmt, wenn das fluoreszierende Ub-Rho-Substrat vom Enzym in Gegenwart verschiedener Inhibitor-Konzentrationen gespalten wird (links). Zusätzlich haben sie auch einen Screenshot der gesamten Platte aufgenommen, der die Auswirkungen der 16 verschiedenen Inhibitoren in doppelter Ausführung zeigt (rechts).

Um das therapeutische Potenzial der USP30-Inhibition als Mechanismus zur Behandlung neurodegenerativer Erkrankungen vollständig zu verstehen, müssen weitere Wirksamkeitsstudien mit diesen Inhibitoren in relevanten Zell- und Tiermodellen durchgeführt werden. Diese Untersuchungen werden Aufschluss über das gewünschte kinetische Profil der USP30-Inhibition und ihre Wirksamkeit bei der Bekämpfung neurodegenerativer Erkrankungen geben.

Quellenangaben

Erfahren Sie mehr über das von Alzheimer’s Research UK finanzierte Oxford Drug Discovery Institute an der University of Oxford

Strukturelle Voraussetzungen für die selektive Inhibition der USP30-Deubiquitinase durch niedermolekulare Benzosulfonamide